- Για την απρόσκοπτη λειτουργία της, ως Φορέας Διαχείρισης Προγραμμάτων, η ΚΕΠΑ-ΑΝΕΜ ΑΜΚΕ συμμετέχει σε κατάλληλα κοινοπρακτικά σχήματα. Συγκεκριμένα από το 2009 στο πλαίσιο συμμετοχής της στον ΕΦΕΠΑΕ., η ΚΕΠΑ-ΑΝΕΜ ΑΜΚΕ έχει αναλάβει την ανάληψη της διαχείρισης δράσεων και προγραμμάτων ευθύνης του ΕΦΕΠΑΕ : ΕΠΑΝ ΙΙ (ΕΣΠΑ 2007-2013), ΕΠΑνΕΚ 2014-2020, ΕΠ “Κεντρική Μακεδονία” 2014-2020, ΕΠ “Δυτικής Μακεδονίας” 2014-2020, Δράση Ενίσχυσης ΜμΕ στις ΠΕ Κοζάνης και Φλώρινας που χρηματοδοτείται από το Πράσινο Ταμείο (Εθνικό Πρόγραμμα), ΕΠΑΝ 2021-2027, Πρόγραμμα “Κεντρική Μακεδονία 2021-2027”, Πρόγραμμα “Δίκαιη Αναπτυξιακή Μετάβαση” 2021-2027.
- Επίσης, λόγω της μεγάλης εμπειρίας και τεχνογνωσίας στα θέματα διαχείρισης προγραμμάτων η ΚΕΠΑ-ΑΝΕΜ ΑΜΚΕ έχει αναπτύξει σημαντικές συνεργασίες και συνέργειες με τοπικούς, περιφερειακούς και πανελλαδικούς επιχειρηματικούς, οικονομικούς και αναπτυξιακούς φορείς (π.χ. Υπουργεία, Διαχειριστικές Αρχές, Επιμελητήρια, Περιφέρειες της Κεντρικής & Δυτικής Μακεδονίας, Εκπαιδευτικά Ιδρύματα (π.χ. ΑΠΘ, ΑΤΕΙΘ) την ΑΖΚ, το ΕΚΕΤΑ, ΣΕΠΒΕ, κ.λ.π.). Παράλληλα, έχει αναδειχθεί σε αξιόπιστο συνομιλητή τόσο των τοπικών κοινωνιών, όσο και των Εθνικών και Ευρωπαϊκών οργάνων για θέματα θεσμικού και ευρύτερα αναπτυξιακού χαρακτήρα, ιδιαίτερα για τις Περιφέρειες της Βόρειας Ελλάδας .