Στο πλαίσιο της πολιτικής ποιότητας και της συνεχούς αναβάθμισης των λειιτουργιών της και των παρεχόμενων υπηρεσιών της προς τις επιχειρήσεις και τον επιχειρηματικό κόσμο της χώρας, ως φορέας διαχείρισης προγραμμάτων, η ΚΕΠΑ-ΑΝΕΜ με αφορμή τη νέα προγραμματική περίοδο 2014-2020 και τη συμμετοχή της στη διαχείριση δράσεων και προγραμμάτων του ΕΠΑνΕΚ, ΕΣΠΑ 2014-2020 ως εταίρος του ΕΦΕΠΑΕ (ΕΦ ΕΠΑνΕΚ), εγκατέστησε σύστημα διαχείρισης ποιότητας, το οποίο πιστοποιήθηκε πρόσφατα, σύμφωνα με το πρότυπο ISO 9001:2015.